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Quando as atividades presenciais de 2020.1 voltarem, a matrícula terá que ser refeita nas matérias em que já estou matriculado de 2020.1? Continuarei matriculado quando retornarem as atividades?

Não.  A matrícula de 2020.1 está apenas suspensa, e quando retomarmos as atividades presenciais ela será reativada.